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Arena-Idb: a platform to build human non-coding RNA interaction networks 1-gen-2018 Bonnici, Vincenzo; De Caro, Giorgio; Constantino, Giorgio; Liuni, Sabino; D'Elia, Domenica; Bombieri, Nicola; Licciulli, Flavio; Giugno, Rosalba
PanDelos: a dictionary-based method forpan-genome content discovery 1-gen-2018 Bonnici, V; Giugno, R; Manca, V
Fast Subgraph Matching Strategies Based on Pattern-Only Heuristics 1-gen-2019 Aparo, Antonino; Bonnici, Vincenzo; Micale, Giovanni; Ferro, Alfredo; Shasha, Dennis; Pulvirenti, Alfredo; Giugno, Rosalba
LErNet: characterization of lncRNAs via context-aware network expansion and enrichment analysis 1-gen-2019 Bonnici, Vincenzo; Caligola, Simone; Fiorini, Giulia; Giudice, Luca; Giugno, Rosalba
Construction and Analysis of miRNA Regulatory Networks 1-gen-2019 Mensi, Antonella; Bonnici, Vincenzo; Caligola, Simone; Giugno, Rosalba
An Efficient Implementation of a Subgraph Isomorphism Algorithm for GPUs 1-gen-2019 Bonnici, V; Giugno, R; Bombieri, N
Simple Pattern-only Heuristics Lead To Fast Subgraph Matching Strategies on Very Large Networks 1-gen-2019 Antonino, Aparo; Bonnici, Vincenzo; Micale, Giovanni; Ferro, Alfredo; Shasha, Dennis; Pulvirenti, Alfredo; Giugno, Rosalba
Parallel Searching on Biological Networks 1-gen-2019 Bombieri, Nicola; Bonnici, Vincenzo; Giugno, Rosalba
Challenges in gene-oriented approaches for pan-genome content discovery 1-gen-2020 Bonnici, Vincenzo; Maresi, Emiliano; Giugno, Rosalba
Centrality Speeds the Subgraph Isomorphism Search Up in Target Aware Contexts 1-gen-2020 Bonnici, Vincenzo; Caligola, Simone; Aparo, Antonino; Giugno, Rosalba
GRAFIMO: variant and haplotype aware motif scanning on pangenome graphs 1-gen-2021 Tognon, Manuel; Bonnici, Vincenzo; Garrison, Erik; Giugno, Rosalba; Pinello, Luca
Variant and haplotype aware motif scanning on genome variation graphs 1-gen-2021 Tognon, Manuel; Bonnici, Vincenzo; Garrison, Erik; Giugno, Rosalba; Pinello, Luca
IT-Covid19-IT: la risposta della comunità informatica italiana alla pandemia 1-gen-2021 Bonnici, Vincenzo; Cicieri, Giovanni; Distefano, Salvatore; Galletta, Letterio; Polignano, Marco; Scaffidi, Carlo
A Word Recurrence Based Algorithm to Extract Genomic Dictionaries 1-gen-2021 Bonnici, Vincenzo; Franco, Giuditta; Manca, Vincenzo
An entropy heuristic to optimize decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 1-gen-2021 Licheri, N.; Amparore, E.; Bonnici, V.; Giugno, R.; Beccuti, M.
TEDAR: Temporal dynamic signal detection of adverse reactions 1-gen-2021 Aparo, A.; Sala, P.; Bonnici, V.; Giugno, R.
GRAPES-DD: exploiting decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 1-gen-2021 Licheri, Nicola; Bonnici, Vincenzo; Beccuti, Marco; Giugno, Rosalba
MODIMO: Workshop on Multi-Omics Data Integration for Modelling Biological Systems 1-gen-2021 Beccuti, M.; Bonnici, V.; Giugno, R.
GRAFIMO: variant and haplotype aware motif scanning on pangenome graphs 1-gen-2021 Tognon, Manuel; Bonnici, Vincenzo; Garrison, Erik; Giugno, Rosalba; Pinello, Luca
Spectral concepts in genome informational analysis 1-gen-2021 Bonnici, V.; Franco, G.; Manca, V.
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