I funghi sono stati trascurati dalla comunità scientifica per molti anni, a causa della loro relativamente bassa patogenicità umana e delle sfide tecniche che hanno ostacolato una profonda conoscenza di questo regno. Ora, grazie all’avvento di nuove tecnologie e scoperte biologiche, c’è un grande consenso scientifico sulla necessità di studiare tutte le dinamiche sottostanti al mondo fungino. I funghi non solo hanno contribuito all'evoluzione dei mammiferi, ma sono attualmente una parte cruciale del nostro microbiota, e durante il corso della vita incontriamo una vasta gamma di specie che interagiscono con i batteri e con le cellule dell'ospite, modellando il nostro sistema immunitario e, in ultima analisi, i nostri corpi. Queste specie, per lo più appartenenti ai lieviti piuttosto che ai funghi filamentosi, potrebbero essere potenzialmente sfruttate per i loro effetti benefici e per lo sviluppo di strategie terapeutiche volte a sviuppare il nostro sistema immunitario. Inoltre, tra tutti i meccanismi esercitati dai lieviti per interagire con altri organismi, si dovrebbe prestare particolare attenzione alle vescicole extracellulari, che sono un mezzo di comunicazione estremamente potente grazie al loro contenuto ricco di molecole antigeniche e regolatorie. Una necessaria ulteriore esplorazione delle vescicole extracellulari microbiche e fungine potrebbe aprire interessanti possibilità nei campi dell'ingegneria genetica, dello sviluppo dei vaccini e dell'immunoterapia. Questa tesi di dottorato ha lo scopo di esplorare la dinamica dei lieviti nelle diverse comunità ecologiche, come gli alimenti fermentati e gli ambienti legati al microbiota umano, nonché di indagare sulle proprietà compositive e funzionali delle vescicole extracellulari di lievito (EVs), un meccanismo di comunicazione evolutivamente conservato da tutti i regni della vita. Oltre a due ampie review, una riguardante l'interazione e la coevoluzione tra le lieviti e gli esseri umani, e l'altra riguardo alle attuali conoscenze sulle EV fungine, questa tesi è suddivisa in tre parti fondamentali, seguendo alcuni dei lavori sperimentali originali ai quali ho contribuito durante il mio dottorato: (i) i ruoli dei lieviti nella fermentazione naturale; (ii) le funzioni metaboliche e immunoregolatorie delle comunità di lieviti e lactobacilli; e (iii) le caratteristiche strutturali, compositive e immunologiche delle EV di lievito.

Extracellular vesicles as means of yeast-host interactions / Nenciarini, S.. - (2023).

Extracellular vesicles as means of yeast-host interactions

NENCIARINI, STEFANO
2023-01-01

Abstract

I funghi sono stati trascurati dalla comunità scientifica per molti anni, a causa della loro relativamente bassa patogenicità umana e delle sfide tecniche che hanno ostacolato una profonda conoscenza di questo regno. Ora, grazie all’avvento di nuove tecnologie e scoperte biologiche, c’è un grande consenso scientifico sulla necessità di studiare tutte le dinamiche sottostanti al mondo fungino. I funghi non solo hanno contribuito all'evoluzione dei mammiferi, ma sono attualmente una parte cruciale del nostro microbiota, e durante il corso della vita incontriamo una vasta gamma di specie che interagiscono con i batteri e con le cellule dell'ospite, modellando il nostro sistema immunitario e, in ultima analisi, i nostri corpi. Queste specie, per lo più appartenenti ai lieviti piuttosto che ai funghi filamentosi, potrebbero essere potenzialmente sfruttate per i loro effetti benefici e per lo sviluppo di strategie terapeutiche volte a sviuppare il nostro sistema immunitario. Inoltre, tra tutti i meccanismi esercitati dai lieviti per interagire con altri organismi, si dovrebbe prestare particolare attenzione alle vescicole extracellulari, che sono un mezzo di comunicazione estremamente potente grazie al loro contenuto ricco di molecole antigeniche e regolatorie. Una necessaria ulteriore esplorazione delle vescicole extracellulari microbiche e fungine potrebbe aprire interessanti possibilità nei campi dell'ingegneria genetica, dello sviluppo dei vaccini e dell'immunoterapia. Questa tesi di dottorato ha lo scopo di esplorare la dinamica dei lieviti nelle diverse comunità ecologiche, come gli alimenti fermentati e gli ambienti legati al microbiota umano, nonché di indagare sulle proprietà compositive e funzionali delle vescicole extracellulari di lievito (EVs), un meccanismo di comunicazione evolutivamente conservato da tutti i regni della vita. Oltre a due ampie review, una riguardante l'interazione e la coevoluzione tra le lieviti e gli esseri umani, e l'altra riguardo alle attuali conoscenze sulle EV fungine, questa tesi è suddivisa in tre parti fondamentali, seguendo alcuni dei lavori sperimentali originali ai quali ho contribuito durante il mio dottorato: (i) i ruoli dei lieviti nella fermentazione naturale; (ii) le funzioni metaboliche e immunoregolatorie delle comunità di lieviti e lactobacilli; e (iii) le caratteristiche strutturali, compositive e immunologiche delle EV di lievito.
2023
Ecologia
fermented foods
kefir
microbial evolution
microbial ecology
yeast
lactobacilli
microbiome
microbiota
metagenomics
genomics
metabolomics
saccharomyces cerevisiae
wasps
social insects
vineyard
mycobiota
host-fungi interactions
host immunity
immunoregulation
immunomodulation
immunotherapy
trained immunity
extracellular vesicles
EVs
yeast extracellular vesicles
fungal extracellular vesicles
fungi
immunity
therapy
host-microbe interactions
drud delivery
vaccine
CAVALIERI, DUCCIO
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