L'obiettivo principale del lavoro presentato in questa tesi di dottorato è legato allo sviluppo di nuovi sistemi multifunzionali a base di acidi peptido nucleici (PNA), modificati al backbone o alle basi azotate, che sono stati utilizzati per il targeting degli acidi nucleici, RNA in particolare, agendo quindi com nuovi strumenti per diversi campi biotecnologici, come il rilevamento di sequenze target di interesse biologico, l'inibizione dell’attività di microRNA (miR) e reazioni template da DNA/RNA. Sono state introdotte diverse modifiche per ottenere compiti specifici, per esempio l'introduzione di una catena laterale di arginina in posizione C2 o C5 è stata sfruttata per il rilevamento su superficie di mutazioni puntiformi (SNP) o per conferire permeabilità cellulare a PNA ad attività anti-miR. Rilevazione di SNP in soluzione è stata ottenuta con l'introduzione di gruppi pirenilici su una timina modificata. Reazioni template da acidi nucleici, targeting miR, sono state utilizzate per innescare il rilascio di molecole funzionali o per la produzione di un segnale fluorescente. Nella parte finale del lavoro, un nuovo approccio per la sintesi di RNasi artificiali è stato proposto sfruttando i risultati precedenti, utilizzando sia backbone che basi azotate modificati.

Modified peptide nucleic acids (PNAs) for nucleic acids detection and anti-miR activity / Manicardi, A.. - (2012 Mar 01).

Modified peptide nucleic acids (PNAs) for nucleic acids detection and anti-miR activity

MANICARDI, Alex
2012-03-01

Abstract

L'obiettivo principale del lavoro presentato in questa tesi di dottorato è legato allo sviluppo di nuovi sistemi multifunzionali a base di acidi peptido nucleici (PNA), modificati al backbone o alle basi azotate, che sono stati utilizzati per il targeting degli acidi nucleici, RNA in particolare, agendo quindi com nuovi strumenti per diversi campi biotecnologici, come il rilevamento di sequenze target di interesse biologico, l'inibizione dell’attività di microRNA (miR) e reazioni template da DNA/RNA. Sono state introdotte diverse modifiche per ottenere compiti specifici, per esempio l'introduzione di una catena laterale di arginina in posizione C2 o C5 è stata sfruttata per il rilevamento su superficie di mutazioni puntiformi (SNP) o per conferire permeabilità cellulare a PNA ad attività anti-miR. Rilevazione di SNP in soluzione è stata ottenuta con l'introduzione di gruppi pirenilici su una timina modificata. Reazioni template da acidi nucleici, targeting miR, sono state utilizzate per innescare il rilascio di molecole funzionali o per la produzione di un segnale fluorescente. Nella parte finale del lavoro, un nuovo approccio per la sintesi di RNasi artificiali è stato proposto sfruttando i risultati precedenti, utilizzando sia backbone che basi azotate modificati.
1-mar-2012
Scienze Chimiche
Peptide nucleic acids
PNA
Modified nucleobase
Modified backbone
Template reaction
Nucleic acid detection
Pyrene excimer
MiR inhibition
MiRNA
Microarrays
MARCHELLI, Rosangela
Corradini, Roberto
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