Il presente lavoro di tesi è stato incentrato sullo sviluppo di metodi per applicazioni riguardanti la sicurezza alimentare e la biologia molecolare. L’analisi di norovirus è stata studiata mediante metodi basati sull’utilizzo di Acidi Peptido Nucleici (PNA): i) un PNA-microarray è stato sviluppato per l’analisi e la determinazione del genogruppo di norovirus; ii) sonde a PNA coniugate con arancio di tiazolo (TO) sono state sviluppate ed utilizzate per l’analisi di norovirus mediante un metodo isotermo di amplificazione, analizzando gli amplificati costituiti da RNA; iii) un nuovo approccio per la concentrazione di norovirus dall’acqua e sucessiva analisi mediante real time RT-PCR è stato investigato. Più in generale, sonde a PNA coniugate con pirene sono state sviluppate per l’analisi di sequenze specifiche e per la determinazione di ‘polimorfismi a singolo nucleotide’ (SNPs). In particolare, un sistema basato su una coppia di sonde è stato utilizzato per l’analisi del polimorfismo PTPN22 C1858T, implicato in svariate malattie autoimmuni incluso il diabete di tipo 1.

Development of PNA-based systems for food safety and molecular biology(2010 Mar).

Development of PNA-based systems for food safety and molecular biology

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2010-03-01

Abstract

Il presente lavoro di tesi è stato incentrato sullo sviluppo di metodi per applicazioni riguardanti la sicurezza alimentare e la biologia molecolare. L’analisi di norovirus è stata studiata mediante metodi basati sull’utilizzo di Acidi Peptido Nucleici (PNA): i) un PNA-microarray è stato sviluppato per l’analisi e la determinazione del genogruppo di norovirus; ii) sonde a PNA coniugate con arancio di tiazolo (TO) sono state sviluppate ed utilizzate per l’analisi di norovirus mediante un metodo isotermo di amplificazione, analizzando gli amplificati costituiti da RNA; iii) un nuovo approccio per la concentrazione di norovirus dall’acqua e sucessiva analisi mediante real time RT-PCR è stato investigato. Più in generale, sonde a PNA coniugate con pirene sono state sviluppate per l’analisi di sequenze specifiche e per la determinazione di ‘polimorfismi a singolo nucleotide’ (SNPs). In particolare, un sistema basato su una coppia di sonde è stato utilizzato per l’analisi del polimorfismo PTPN22 C1858T, implicato in svariate malattie autoimmuni incluso il diabete di tipo 1.
mar-2010
Scienze e Tecnologie Alimentari
Isothermal-based ampification
Real time PCR
Peptide Nucleic Acid (PNA)
Norovirus
Single nucleotide polymorphism (SNP)
Thiazole orange (TO)
Pyrene
MARCHELLI, Rosangela
TEDESCHI, Tullia
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