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Assessing the fecal microbiota: an optimized Ion Torrent 16S rRNA gene-based analysis protocol. PloS One 1-gen-2013 Milani, C.; Hevia, A.; Foroni, E.; Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Lugli, G. A.; Sanchez, B.; Martín, R.; Gueimonde, M.; van Sinderen, D.; Margolles, A.; Ventura, Marco
Lactococcus garvieae: Where Is It From? A First Approach to Explore the Evolutionary History of this Emerging Pathogen 1-gen-2013 Ferrario, Chiara; Giovanni, Ricci; Milani, Christian; Lugli, Gabriele Andrea; Ventura, Marco; Eraclio, G.; Borgo, F.; Grazia, Fortina
Comparative genomics of Bifidobacterium animalis subsp. lactis reveals a strict monophyletic bifidobacterial taxon 1-gen-2013 Milani, C.; Duranti, Sabrina; Lugli, G. A.; Bottacini, F.; Strati, F.; Arioli, S.; Foroni, E.; Turroni, Francesca; van Sinderen, D.; Ventura, Marco
Evaluation of bifidobacterial community composition in the human gut by means of a targeted amplicon sequencing (ITS) protocol 1-gen-2014 Milani, Christian; Lugli, Gabriele Andrea; Turroni, Francesca; Mancabelli, Leonardo; Duranti, Sabrina; Alice, Viappiani; Marta, Mangifesta; Nicola, Segata; Douwe van Sinderen, ; Ventura, Marco
Investigation of the evolutionary development of the genus Bifidobacterium by comparative genomics 1-gen-2014 Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Turroni, Francesca; Duranti, Sabrina; Ferrario, Chiara; Alice, Viappiani; Mancabelli, Leonardo; Marta, Mangifesta; Bernard, Taminiau; Veronique, Delcenserie; Douwe van Sinderen, ; Ventura, Marco
Genomic encyclopedia of type strains of the genus Bifidobacterium 1-gen-2014 Milani, Christian; Lugli, Gabriele Andrea; Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Francesca, Bottacini; Marta, Mangifesta; Borja, Sanchez; Alice, Viappiani; Mancabelli, Leonardo; Bernard, Taminiau; Veronique, Delcenserie; Rodoplhe, Barrangou; Abelardo, Margolles; Douwe van Sinderen, ; Ventura, Marco
Bifidobacteria and humans: our special friends, from ecological to genomics perspectives 1-gen-2014 Ventura, Marco; Turroni, Francesca; Lugli, G. A.; van Sinderen, D.
Genome sequence of Bifidobacterium moukalabense DSM 27321 highlights closest phylogenetic relatedness with Bifidobacterium dentium taxon 1-gen-2014 Lugli, Gabriele Andrea; Duranti, Sabrina; Milani, Christian; Turroni, Francesca; Alice, Viappiani; Marta, Mangifesta; Douwe van, Sinderen; Ventura, Marco
Genomic characterization and transcriptional studies of the starch-utilizing Bifidobacterium adolescentis 22L 1-gen-2014 Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Alice, Viappiani; Marta, Mangifesta; Gioiosa, Laura; Palanza, Paola; Douwe van, Sinderen; Ventura, Marco
Comparative genomics of the Bifidobacterium breve taxon 1-gen-2014 Francesca, Bottacini; Mary O' Connell, Motherway; J., Kuczynski; KJ O', Connell; Fausta, Serafini; Duranti, Sabrina; Milani, Christian; Turroni, Francesca; Lugli, Gabriele Andrea; Aldert, Zomer; D., Zhurina; Christian, Riedel; Ventura, Marco; Douwe van, Sinderen
Bifidobacterium bifidum PRL2010 modulates host innate immune response 1-gen-2014 Turroni, Francesca; Valentina, Taverniti; Patricia Ruas, Madiedo; Duranti, Sabrina; Simone, Guglielmetti; Lugli, Gabriele Andrea; Gioiosa, Laura; Palanza, Paola; Abelardo, Margolles; Douwe van, Sinderen; Ventura, Marco
Kefir fermented milk and kefiran promote growth of Bifidobacterium bifidum PRL2010 and modulate its gene expression 1-gen-2014 Fausta, Serafini; Turroni, Francesca; Patricia Ruas, Madiedo; Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Duranti, Sabrina; Nicole, Zamboni; Francesca, Bottacini; Douwe van, Sinderen; Abelardo, Margolles; Ventura, Marco
Exploring amino acid auxotrophy in Bifidobacterium bifidum PRL2010 1-gen-2015 Ferrario, Chiara; Duranti, Sabrina; Milani, C; Mancabelli, Leonardo; Lugli, Gabriele Andrea; Turroni, Francesca; Mangifesta, M; Viappiani, A; Ossiprandi, Maria Cristina; van Sinderen, D; Ventura, Marco
Occurrence and diversity of CRISPR-Cas systems in the genus Bifidobacterium 1-gen-2015 Briner, Ae; Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Gueimonde, M; Margolles, A; VAN SINDEREN, Douwe; Ventura, Marco; Barrangou, R.
Insights from genomes of representatives of the human gut commensal Bifidobacterium bifidum 1-gen-2015 Duranti, Sabrina; Milani, Christian; Lugli, Ga; Turroni, F; Mancabelli, L; Turroni, Francesca; Sanchez, B; Ferrario, Chiara; Viappiani, A; Mangifesta, M; Mancino, Walter; Gueimonde, M; Margolles, A; van Sinderen, D; Ventura, Marco
A genome-based identification approach for members of the genus Bifidobacterium 1-gen-2015 Ferrario, Chiara; Milani, Christian; Mancabelli, L; Lugli, Ga; Turroni, Francesca; Duranti, Sabrina; Mangifesta, M; Viappiani, A; Sinderen, Dv; Ventura, Marco
Bifidobacteria exhibit social behavior through carbohydrate resource sharing in the gut 1-gen-2015 Milani, Christian; Lugli, Gabriele Andrea; Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Mancabelli, Leonardo; Ferrario, Chiara; Mangifesta, M; Hevia, A; Viappiani, A; Scholz, M; Arioli, S; Sanchez, B; Lane, J; Ward, Dv; Hickey, R; Mora, D; Segata, N; Margolles, A; van Sinderen, D; Ventura, Marco
Exploring vertical transmission of bifidobacteria from mother to child 1-gen-2015 Milani, Christian; Mancabelli, Leonardo; Lugli, Gabriele Andrea; Duranti, Sabrina; Turroni, Francesca; Ferrario, Chiara; Mangifesta, M; Viappiani, A; Ferretti, P; Gorfer, V; Tett, A; Segata, N; van Sinderen, D; Ventura, Marco
MEGAnnotator: a user-friendly pipeline for microbial genomes assembly and annotation 1-gen-2016 Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Mancabelli, Leonardo; van Sinderen, D; Ventura, Marco
Prophages of the genus Bifidobacterium as modulating agents of the infant gut microbiota 1-gen-2016 Lugli, Gabriele Andrea; Milani, Christian; Turroni, Francesca; Tremblay, D; Ferrario, Chiara; Mancabelli, Leonardo; Duranti, Sabrina; Ward, D. V; Ossiprandi, Maria Cristina; Moineau, S; Van Sinderen, D; Ventura, Marco
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